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派遣社員の年末調整はどうなる?必要書類や流れ、確定申告が必要なケースを徹底解説
派遣社員の年末調整はどうなる?必要書類や流れ、確定申告が必要なケースを徹底解説
目次
年末調整とは?派遣社員にも必要?

年末調整とは、1年間に支払われた給与から天引きされた所得税の金額を正しく精算する手続きのことです。多くの場合、勤務先の会社が従業員に代わって行います。派遣社員も、年末時点で派遣会社に在籍していれば、原則として年末調整の対象になります。
ただし、途中で派遣契約が終了した場合や転職した場合などは、自分で確定申告を行う必要があるケースもあるので注意してください。
年末調整と確定申告の違い
年末調整は、勤務先が従業員に代わって所得税を再計算し、払いすぎ・不足分を調整する手続きです。一方、確定申告は自分で1年分の所得と税金を計算し、税務署に申告する制度です。
会社員や派遣社員の場合は、通常勤務先が年末調整を行うため確定申告は不要ですが、複数の勤務先がある場合や医療費控除・住宅ローン控除を受けたい場合などは、自分で確定申告を行う必要があります。
派遣社員の年末調整の流れ

派遣社員の場合、年末調整は勤務している「派遣会社」が行います。勤務先(派遣先企業)ではなく、給与を支払っている派遣会社に書類を提出する点が重要です。
例年、11月頃に案内が届き、必要書類を提出することで自動的に税金の精算が行われます。以下では、派遣社員の年末調整の流れを具体的に解説します。
派遣会社から年末調整の案内が届く
年末が近づくと、派遣会社から「年末調整のお知らせ」や「扶養控除申告書」などの案内が郵送またはメールで届きます。
案内には提出期限や必要書類の記入方法が記載。記入漏れや遅延があると年内に手続きが間に合わない場合もあるため、早めに確認・対応しましょう。案内が届かない場合は、派遣会社の担当者に連絡して確認することが大切です。
提出が必要な書類一覧
派遣社員の年末調整で提出が必要な主な書類は以下の通りです。
- 扶養控除等申告書:扶養家族の有無や配偶者の所得を申告。
- 保険料控除申告書兼配偶者特別控除申告書:生命保険や地震保険などの控除額を申請。
- 保険料控除証明書:各保険会社から届く証明書を添付。
- 住宅借入金等特別控除申告書(住宅ローンがある場合)。
これらの書類を期限までに派遣会社へ提出しましょう。
還付・追加徴収の確認
年末調整の結果、所得税を多く払いすぎていた場合は「還付金」として給与と一緒に返金されます。逆に、納税額が不足していた場合は「追加徴収」として差額が引かれます。
派遣会社から送られる源泉徴収票で、最終的な金額を確認しましょう。もし控除申告の漏れがあった場合でも、翌年に確定申告をすれば、還付を受けることが可能です。
派遣社員でも確定申告が必要なケース

派遣社員でも、条件によっては自分で確定申告を行う必要があります。たとえば、年末時点で派遣会社に所属していない場合や、複数の派遣会社で働いていた場合などです。
また、副業収入や医療費・住宅ローン控除を申請したい場合も該当します。以下で、確定申告が必要となる代表的なケースを紹介します。
年末時点で派遣会社に在籍していない場合
年の途中で派遣契約が終了し、12月31日時点で派遣会社に在籍していない場合は、年末調整の対象外になります。
そのため、自分で確定申告を行い、1年間の所得税を精算する必要があります。派遣会社から発行される「源泉徴収票」をもとに、税務署またはe-Taxで申告します。申告期間は原則として翌年の2月16日〜3月15日です。
複数の派遣会社を掛け持ちしている場合
同じ年に複数の派遣会社で働いていた場合、年末調整を受けられるのは1社のみです。
複数の会社から給与を受け取っていると、所得税が正しく計算されないため、確定申告で全ての収入を合算して申告する必要があります。各派遣会社から「源泉徴収票」を受け取り、申告時に提出しましょう。
特に短期派遣や掛け持ち勤務をしている人は注意が必要です。
副業で20万円以上の収入がある場合
派遣の仕事以外に、副業やフリーランス活動などで年間20万円を超える所得がある場合は、確定申告が必要です。
副業収入が少額でも、源泉徴収が行われていない場合は税金未納となる可能性があります。副業分の収入や経費を記録し、確定申告で正確に報告しましょう。会社に副業を知られたくない場合でも、住民税の申告方法を工夫することで対応可能です。
医療費控除・住宅ローン控除を受けたい場合
年間の医療費が10万円を超えた場合や、住宅ローンを利用して住宅を購入した場合は、確定申告で控除を受けることができます。
これらの控除は年末調整では対応していないため、別途申告が必要です。医療費の領収書や住宅ローンの借入金証明書を用意し、確定申告書に添付します。申告により所得税の還付が受けられる場合もあるため、忘れずに行いましょう。
確定申告の流れ

確定申告は、1年間(1月1日〜12月31日)の所得と税金を自分で申告・精算する手続きです。派遣社員が確定申告を行う場合、まず「源泉徴収票」を派遣会社から受け取り、収入額や控除内容を確認します。
続いて、国税庁の「確定申告書等作成コーナー」またはe-Taxを使い、必要事項を入力。医療費控除や副業収入などがある場合は、その証明書や領収書を添付します。
申告書は、オンライン送信または税務署への持参・郵送で提出可能です。還付金がある場合は、申告から約1〜2か月後に指定口座へ振り込まれます。
「アスタワーク」なら派遣社員の年末調整がスムーズ

出典:アスタワーク
「アスタワーク」は、派遣スタッフ一人ひとりの働きやすさを大切にする派遣会社です。
年末調整の案内や必要書類の提出も、オンラインで簡単に完結できるため、初めての方でも安心です。担当者が丁寧にサポートしてくれるので、控除の申請漏れや書類不備の心配も少なく、スムーズに手続きが進みます。
また、労務管理体制も整っており、給与明細や源泉徴収票の発行も迅速。派遣社員が安心して働ける環境を整えているのが「アスタワーク」の大きな特徴です。
派遣の年末調整についてよくある質問
Q. 派遣社員でも年末調整をしてもらえる?
A. 派遣社員でも年末時点で派遣会社に在籍していれば、基本的に年末調整の対象になります。
派遣先企業ではなく、給与を支払っている「派遣会社」が手続きを行います。通常、11月頃に年末調整に関する案内が届くため、指示に従って書類を提出すればOKです。
ただし、年末に契約が終了している場合や、他社でも働いている場合は、年末調整ではなく確定申告が必要になることがあります。
Q. 年の途中で派遣契約が終了した場合年末調整はどうなる?
A. 年の途中で派遣契約が終了し、12月31日時点で派遣会社に在籍していない場合、その派遣会社では年末調整が行われません。
この場合、自分で確定申告を行って所得税を精算する必要があります。派遣会社から受け取る「源泉徴収票」をもとに、他の収入がある場合は合算して申告します。
もし再び別の派遣会社で働き始めた場合でも、それぞれの源泉徴収票を使って1年分の収入をまとめて確定申告する形になります。
Q. 複数の派遣会社で働いている場合どうすればいい?
A. 複数の派遣会社で働いていた場合、年末調整を受けられるのは1社のみです。
残りの派遣会社分の給与は、自分で確定申告して合算する必要があります。各派遣会社から送付される「源泉徴収票」を集め、確定申告書にすべての収入額を記載します。
これを行わないと、本来支払うべき所得税額とずれが生じ、追徴課税の対象になる可能性もあります。短期派遣や掛け持ち勤務をしている方は特に注意しましょう。
Q. 副業をしている場合も年末調整で完結する?
A. 副業がある場合、年末調整では本業分の所得しか対象になりません。
副業での収入が年間20万円を超える場合は、確定申告を行う必要があります。副業先が給与所得で源泉徴収をしていない場合や、フリーランス・アルバイト収入がある場合も同様です。
確定申告では、本業と副業の所得を合算して申告します。なお、副業収入が20万円以下でも、住民税の申告が必要な場合があるため、自治体に確認しておきましょう。
Q. 年末調整の還付金はいつ受け取れる?
A. 年末調整で所得税が払いすぎていた場合、還付金は12月または翌年1月の給与に上乗せされて支給されるのが一般的です。
派遣会社によっては、翌月の給与と一緒に支給されるケースもあります。還付額は、生命保険料控除や扶養控除などの申告内容によって異なります。
年末調整が完了すると「源泉徴収票」が発行されるため、内容を確認し、還付金が適切に反映されているかチェックしましょう。
派遣社員も年末調整の対象
派遣社員も、年末時点で派遣会社に在籍していれば年末調整の対象になります。手続きを行うのは勤務先企業ではなく、給与を支払っている派遣会社です。
案内が届いたら早めに書類を提出し、控除漏れのないようにしましょう。もし年末に契約が終了していたり、複数の派遣会社で働いていた場合は、確定申告が必要になるケースもあります。
正しい手続きを行うことで、払いすぎた税金をしっかり還付してもらうことができます。
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